أهداف الهيئة تنحصر في العمل على إسقاط النظام الطائفي المجرم، ومقاومة الاحتلالين الروسي والإيراني حتى تحرير ثرى الشام، وإقامة نظام حكم إسلامي يليق بتضحيات الشعب السوري.